Une petite partie du secteur de la plaine d’Aunis est classée en arrêté de protection de biotope, les Pierrières du Thou (1,20 ha). Une autre petite partie de ce secteur, au sud, fait partie d’une ZICO de 17 550 ha et qui comprend quatre autres secteurs : la Baie d’Yves, la presqu’île de Fouras, les marais de Rochefort et la plaine du nord de la Saintonge.
Le district de La Rochelle mène actuellement une réflexion sur son développement vers la plaine, élabore un schéma directeur dans lequel les critères de paysage prennent une place fondatrice. Les frontières de l’agglomération, les continuités de paysage ouvert en direction du centre, la concentration des localités, sont intégrées au départ du projet de territoire, et seront en mesure de garantir la lisibilité des paysages de la plaine et la netteté des franges de l’agglomération. Un projet d’aménagement de la rivière le Curé est en réalisation avec une canalisation et un exutoire en mer. De plus, de Fontenay le Comte à Rochefort, une autoroute est en projet. Le Pays d’Aunis vient d’effectuer un plan de paysage et prépare par ailleurs un schéma des circuits vélo. Diverses communes sont engagées dans des révisions de POS comprenant un volet paysager important.