Structure partenariale, le Conservatoire est composé de trois collèges :
Chacune des structures désigne ses représentants.

Pour le premier collège sont désignés :
* le Président du Conseil Régional Poitou-Charentes ou son représentant,
* 6 représentants du Conseil Régional,
* le Président du Conseil Général de la Charente ou son représentant,
* le Président du Conseil Général de la Charente-Maritime ou son représentant,
* le Président du Conseil Général des Deux-Sèvres ou son représentant,
* le Président du Conseil Général de la Vienne ou son représentant,
* le Président du Conseil Économique et Social Régional ou son représentant,
* le Président de l’Université ou son représentant,
* 1 maire désigné par l’Association Départementale des Maires de la Charente,
* 1 maire désigné par l’Association Départementale des Maires de la Charente-Maritime,
* 1 maire désigné par l’Association Départementale des Maires des Deux-Sèvres,
* 1 maire désigné par l’Association Départementale des Maires de la Vienne.
Pour le deuxième collège sont désignés :
* le Président de Poitou-Charentes Nature/Union Centre Atlantique des Associations de Protection de la Nature et de l’Environnement ou son représentant,
* 6 représentants de Poitou-Charentes Nature/Union Centre Atlantique des Associations de Protection de la Nature et de l’Environnement ou leurs représentants,
* le Président de la Fédération Régionale Cynégétique Poitou-Charentes ou son représentant,
* 2 représentants désignés par la Fédération Régionale Cynégétique Poitou-Charentes,
* 2 représentants des Fédérations Départementales pour la Pêche et la protection du milieu aquatique
* le Directeur Régional de l’Office National des Forêts ou son représentant
* 1 représentant désigné par le Syndicat de la propriété foncière et agricole pour la région Poitou-Charentes
* 1 représentant désigné par le Centre Régional de la Propriété Forestière
* 3 représentants désignés par la Chambre Régionale d’Agriculture.
* 1 représentant de la Section Régionale Conchylicole.
Le troisième collège est constitué des membres adhérents de l’association.
Chaque collège élit ses représentants au Conseil d’Administration.
